Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm37562-201ENSMUST00000194763 4328 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 C230031I18Rik-201ENSMUST00000197856 3698 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm12379-201ENSMUST00000119607 391 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm25967-201ENSMUST00000157168 147 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm17186-201ENSMUST00000171742 456 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm21827-201ENSMUST00000178247 423 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm37836-201ENSMUST00000195875 175 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 AC133598.4-202ENSMUST00000225267 469 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm25140-201ENSMUST00000083254 140 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Elavl4-206ENSMUST00000106601 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Olfr1300-ps1-201ENSMUST00000208175 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm24720-201ENSMUST00000157518 166 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm24507-201ENSMUST00000157683 134 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm25071-201ENSMUST00000175232 70 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm28959-201ENSMUST00000186713 551 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 AC156798.1-201ENSMUST00000220508 224 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 B130011K05Rik-201ENSMUST00000151765 3270 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 AC135119.1-201ENSMUST00000227935 3717 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm37670-201ENSMUST00000193622 229 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm37417-201ENSMUST00000195257 454 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm43020-201ENSMUST00000197178 372 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm43749-201ENSMUST00000199345 352 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Olfr1020-202ENSMUST00000215347 2640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Ccr2-202ENSMUST00000165984 3515 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm6639-202ENSMUST00000196841 2666 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm36931-201ENSMUST00000192997 4801 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm22473-201ENSMUST00000104114 132 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Mup-ps20-201ENSMUST00000121132 389 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm26026-201ENSMUST00000122726 123 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 1700092C17Rik-201ENSMUST00000135792 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm24751-201ENSMUST00000157844 102 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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