Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm24921-201ENSMUST00000083024 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Vmn2r-ps69-201ENSMUST00000173382 2565 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Igkv20-101-2-201ENSMUST00000200406 339 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm43500-201ENSMUST00000201067 312 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Olfr795-ps1-201ENSMUST00000205245 763 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 AC156795.1-201ENSMUST00000214655 414 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm24035-201ENSMUST00000082867 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Olfr1048-201ENSMUST00000099900 963 ntAPPRIS P2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm17146-201ENSMUST00000108464 372 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Olfr1186-201ENSMUST00000121619 1090 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm26348-201ENSMUST00000157528 240 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Rpl30-ps6-201ENSMUST00000163337 348 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm23415-201ENSMUST00000175519 83 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm27755-201ENSMUST00000184623 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm34599-201ENSMUST00000198924 288 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm45658-201ENSMUST00000209197 580 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 AC154484.1-201ENSMUST00000227311 771 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Olfr1229-202ENSMUST00000213883 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Olfr747-204ENSMUST00000213238 1416 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm13853-201ENSMUST00000155496 557 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm17542-201ENSMUST00000169859 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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