Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm25105-201ENSMUST00000122477 130 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm23602-201ENSMUST00000157258 132 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Mir7682-201ENSMUST00000198467 58 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm44371-201ENSMUST00000204148 467 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm45245-201ENSMUST00000210082 376 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 AC162934.1-201ENSMUST00000222880 309 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 AC129219.3-201ENSMUST00000223790 196 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 AL645546.1-201ENSMUST00000225001 189 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 2410024N13Rik-201ENSMUST00000090704 669 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Elavl4-202ENSMUST00000102723 4024 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm43508-201ENSMUST00000197251 3783 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r43-205ENSMUST00000228709 12646 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Olfr677-202ENSMUST00000213204 3227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Ntrk3-201ENSMUST00000039431 19703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm14636-202ENSMUST00000150801 5060 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Nlrp4b-201ENSMUST00000047809 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Mmp1b-201ENSMUST00000047888 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Dock11-202ENSMUST00000115264 1725 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Olfr388-ps1-201ENSMUST00000118336 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Btbd35f5-201ENSMUST00000179538 1950 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 1810006J02Rik-201ENSMUST00000186473 1687 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Mir667-201ENSMUST00000102441 92 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Igkv9-129-201ENSMUST00000103308 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm11430-201ENSMUST00000121317 217 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm11534-201ENSMUST00000125956 204 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm15643-201ENSMUST00000126556 383 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm16024-201ENSMUST00000128841 171 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm23231-201ENSMUST00000157299 104 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm16490-201ENSMUST00000165299 351 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 H2al1k-201ENSMUST00000178196 510 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 1700024B18Rik-201ENSMUST00000190088 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Olfr1114-ps1-201ENSMUST00000213896 456 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Defb11-201ENSMUST00000051965 317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm23677-201ENSMUST00000083156 104 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Enam-202ENSMUST00000199104 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Fam46d-204ENSMUST00000167154 3004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Zfp600-204ENSMUST00000168483 4244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Olfr213-202ENSMUST00000220008 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Ddx60-201ENSMUST00000070631 6535 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Olfr1180-203ENSMUST00000217320 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Olfr1369-ps1-203ENSMUST00000213922 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm15994-201ENSMUST00000118029 402 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm14687-201ENSMUST00000120206 363 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm24059-201ENSMUST00000157493 312 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm20399-201ENSMUST00000174652 132 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm36934-201ENSMUST00000192007 306 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm45614-201ENSMUST00000209994 721 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 AC124581.4-201ENSMUST00000225874 463 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm18609-201ENSMUST00000203370 3601 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r90-207ENSMUST00000227692 7101 ntAPPRIS P2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 AC116557.1-201ENSMUST00000219494 1521 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Olfr1016-202ENSMUST00000216425 2698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Olfr642-202ENSMUST00000214299 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Olfr986-202ENSMUST00000214763 3274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Vwc2l-203ENSMUST00000161937 4323 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Abi3bp-204ENSMUST00000171000 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Olfr33-202ENSMUST00000216312 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Cngb3-201ENSMUST00000102999 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm26387-201ENSMUST00000104238 132 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm15026-201ENSMUST00000119219 458 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm16327-201ENSMUST00000137146 228 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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