Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11456-201ENSMUST00000121070 256 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Ear-ps3-201ENSMUST00000168308 445 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm19641-201ENSMUST00000188432 417 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45742-201ENSMUST00000212400 433 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 AC154527.5-201ENSMUST00000224448 496 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42721-201ENSMUST00000197165 1523 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp971-202ENSMUST00000108926 1413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14981-201ENSMUST00000117325 943 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23415-201ENSMUST00000175519 83 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5935-202ENSMUST00000178986 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 AC166358.6-201ENSMUST00000221834 1206 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Trav16-201ENSMUST00000103667 420 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13082-201ENSMUST00000118877 561 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11891-201ENSMUST00000121241 619 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc39Q9D5Y1 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Gm17542-201ENSMUST00000169859 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc39Q9D5Y1 4930505G20Rik-201ENSMUST00000176582 561 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Mir6917-201ENSMUST00000184111 61 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42828-201ENSMUST00000199669 469 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc39Q9D5Y1 4930567K20Rik-203ENSMUST00000220108 646 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc39Q9D5Y1 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc39Q9D5Y1 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc39Q9D5Y1 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc39Q9D5Y1 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc39Q9D5Y1 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc39Q9D5Y1 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc39Q9D5Y1 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Mir421-201ENSMUST00000083575 76 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc39Q9D5Y1 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43092-201ENSMUST00000202986 1854 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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