Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Anks1b-207ENSMUST00000182045 544 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 CT573422.1-201ENSMUST00000216655 405 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 AC165146.1-201ENSMUST00000223777 900 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm24840-201ENSMUST00000122603 147 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm24754-201ENSMUST00000177997 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm35548-201ENSMUST00000214348 441 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Olfr305-201ENSMUST00000069236 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm9043-201ENSMUST00000119677 314 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm12238-201ENSMUST00000127764 124 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm19457-201ENSMUST00000200995 448 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm45173-201ENSMUST00000206819 305 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 AC121114.1-201ENSMUST00000228522 570 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Hsf3-205ENSMUST00000179832 1972 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm6445-201ENSMUST00000189515 1112 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm38149-201ENSMUST00000191943 339 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm3333-202ENSMUST00000221763 1044 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc47Q9D024 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm4758-201ENSMUST00000114851 291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm11430-201ENSMUST00000121317 217 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm45226-201ENSMUST00000206602 288 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm36944-201ENSMUST00000192257 2759 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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