Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps58-201ENSMUST00000174460 840 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm45860-201ENSMUST00000212700 334 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1461-201ENSMUST00000053772 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1462-201ENSMUST00000076832 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm10038-201ENSMUST00000077233 441 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm13087-201ENSMUST00000118298 256 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm14840-201ENSMUST00000122135 594 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Prl2c5-204ENSMUST00000151144 623 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm17969-201ENSMUST00000185706 2557 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Mup-ps13-201ENSMUST00000120662 545 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 9830004L10Rik-202ENSMUST00000188074 687 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm43284-201ENSMUST00000200103 253 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1453-201ENSMUST00000087773 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm43092-201ENSMUST00000202986 1854 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm13239-201ENSMUST00000119920 637 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm26027-201ENSMUST00000122725 268 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm29641-201ENSMUST00000188955 259 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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