Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Olfr204-201ENSMUST00000072517 918 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm22423-201ENSMUST00000082861 184 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm44254-201ENSMUST00000204184 322 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Olfr1355-201ENSMUST00000078414 3317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Tspy-ps-202ENSMUST00000172304 321 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Mir669f-201ENSMUST00000103850 121 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Sult1b1-201ENSMUST00000031199 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm25506-201ENSMUST00000104339 70 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm20619-204ENSMUST00000181343 786 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm12401-201ENSMUST00000118435 228 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm13868-201ENSMUST00000122411 294 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm15157-201ENSMUST00000121852 702 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm23528-201ENSMUST00000104571 132 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 n-R5s52-201ENSMUST00000104614 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm23585-201ENSMUST00000157656 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm20386-201ENSMUST00000174010 132 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Pnrc2-203ENSMUST00000180300 171 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm43500-201ENSMUST00000201067 312 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms