Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Tpm4Q6IRU2 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Tpm4Q6IRU2 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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Tpm4Q6IRU2 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Tpm4Q6IRU2 Gm37098-201ENSMUST00000192290 244 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Tpm4Q6IRU2 Gm37449-201ENSMUST00000193016 270 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Tpm4Q6IRU2 Gm18658-201ENSMUST00000195558 270 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Tpm4Q6IRU2 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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Tpm4Q6IRU2 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
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Tpm4Q6IRU2 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
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Tpm4Q6IRU2 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Tpm4Q6IRU2 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Tpm4Q6IRU2 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
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Tpm4Q6IRU2 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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Tpm4Q6IRU2 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Tpm4Q6IRU2 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
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Tpm4Q6IRU2 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm4Q6IRU2 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm4Q6IRU2 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm4Q6IRU2 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm4Q6IRU2 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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Tpm4Q6IRU2 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm4Q6IRU2 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm4Q6IRU2 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm4Q6IRU2 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm4Q6IRU2 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm4Q6IRU2 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm4Q6IRU2 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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