Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Olfr934-202ENSMUST00000214324 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Olfr609-203ENSMUST00000216360 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm44925-201ENSMUST00000208879 2110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm597-201ENSMUST00000059937 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Trav16-201ENSMUST00000103667 420 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm24119-201ENSMUST00000103979 246 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm12902-201ENSMUST00000118389 322 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm9119-201ENSMUST00000118866 495 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Uqcrh-ps2-201ENSMUST00000121613 269 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 n-R5s179-201ENSMUST00000122564 118 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Mir3964-201ENSMUST00000174898 74 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm28163-201ENSMUST00000187099 325 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm44824-201ENSMUST00000207021 229 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Hormad1-202ENSMUST00000090797 1511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm37999-201ENSMUST00000195178 1809 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Cyp3a44-201ENSMUST00000067479 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm37645-201ENSMUST00000194285 3556 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm26020-201ENSMUST00000122729 183 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm22792-201ENSMUST00000157225 133 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm23053-201ENSMUST00000175136 96 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm24315-201ENSMUST00000177835 127 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm22956-201ENSMUST00000122520 80 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Mir7j-201ENSMUST00000184427 122 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rbbp4Q60972 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.5 ms