Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm29574-201ENSMUST00000186226 696 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm28828-201ENSMUST00000186601 696 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm29307-201ENSMUST00000187367 696 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm29339-201ENSMUST00000189613 696 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm28159-201ENSMUST00000190296 696 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm29407-201ENSMUST00000191468 696 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 AC124400.1-201ENSMUST00000225779 193 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm4894-201ENSMUST00000067007 357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 CT010444.1-201ENSMUST00000219963 3845 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Olfr1326-ps1-201ENSMUST00000059880 3637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Macc1-204ENSMUST00000222058 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm37494-202ENSMUST00000188038 16021 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Q3U6N9 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm13424-201ENSMUST00000122301 354 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm8041-201ENSMUST00000199755 616 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Q3U6N9 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Q3U6N9 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Mannr-201ENSMUST00000193549 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Vmn2r27-201ENSMUST00000100968 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Olfr901-203ENSMUST00000216644 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Q3U6N9 D930036K23Rik-201ENSMUST00000191894 3964 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Ugp2-202ENSMUST00000102875 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Sycp2-201ENSMUST00000081134 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm14440-202ENSMUST00000109051 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm3259-201ENSMUST00000101015 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Rps15a-ps7-201ENSMUST00000117430 392 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm27445-201ENSMUST00000184484 72 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 C130023A14Rik-201ENSMUST00000193537 3087 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm39147-201ENSMUST00000211376 465 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm3956-201ENSMUST00000164882 2560 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Vmn2r36-201ENSMUST00000170402 2561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Cp-204ENSMUST00000108328 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Lztfl1-201ENSMUST00000026274 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Strbp-201ENSMUST00000028279 16348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Zbtb41-201ENSMUST00000039867 8361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Olfr1404-202ENSMUST00000216556 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm26387-201ENSMUST00000104238 132 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Q3U6N9 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.8 ms