Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm44703-201ENSMUST00000205724 248 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 n-R5s52-201ENSMUST00000104614 113 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm13511-201ENSMUST00000121167 363 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm27313-201ENSMUST00000183500 142 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Ms4a4a-201ENSMUST00000188995 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm43236-201ENSMUST00000197414 313 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm45438-201ENSMUST00000210242 564 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm45814-201ENSMUST00000212646 775 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 4930555G07Rik-202ENSMUST00000219879 750 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Zfp711-201ENSMUST00000071814 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Olfr142-202ENSMUST00000213968 3630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Ifi208-201ENSMUST00000085876 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Trdn-208ENSMUST00000219982 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Vmn1r45-203ENSMUST00000227122 2861 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 5330434G04Rik-203ENSMUST00000142109 3449 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 A630033H20Rik-205ENSMUST00000167673 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Adam29-201ENSMUST00000053441 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm37983-201ENSMUST00000193207 2006 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Slc25a36-201ENSMUST00000035024 4043 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm35835-202ENSMUST00000216984 3350 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Tcrg-V5-201ENSMUST00000103556 293 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm13692-201ENSMUST00000120774 371 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm11337-201ENSMUST00000144770 335 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Mir5127-201ENSMUST00000175295 71 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm28141-201ENSMUST00000186676 342 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Fabp9-203ENSMUST00000193487 486 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Ighv1-40-201ENSMUST00000194231 345 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 AC116589.1-201ENSMUST00000220634 327 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Mir21a-201ENSMUST00000083521 92 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Adgre4-201ENSMUST00000025004 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm43958-201ENSMUST00000204360 3544 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm14440-202ENSMUST00000109051 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Olfr1211-203ENSMUST00000213412 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm25308-201ENSMUST00000104171 158 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm16216-201ENSMUST00000118970 1111 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm15190-201ENSMUST00000120855 276 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm13419-201ENSMUST00000121711 271 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm8840-201ENSMUST00000122454 386 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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