Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm17186-201ENSMUST00000171742 456 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm28650-201ENSMUST00000188413 411 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm38231-201ENSMUST00000192030 347 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Igkv13-56-1-201ENSMUST00000198481 209 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm34599-201ENSMUST00000198924 288 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm45551-201ENSMUST00000211459 928 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 AC156574.2-201ENSMUST00000228023 282 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm13627-201ENSMUST00000119700 706 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm15103-201ENSMUST00000119893 871 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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Ttc39dQ0VF76 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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Ttc39dQ0VF76 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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Ttc39dQ0VF76 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm7858-201ENSMUST00000190177 622 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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Ttc39dQ0VF76 Gm10337-201ENSMUST00000096145 165 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
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Ttc39dQ0VF76 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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Ttc39dQ0VF76 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
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Ttc39dQ0VF76 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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Ttc39dQ0VF76 Olfr815-201ENSMUST00000071557 951 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.55□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Gm6395-201ENSMUST00000167639 691 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ttc39dQ0VF76 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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