Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 AC091783.5-201ENSMUST00000224928 671 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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Sh3bp2Q06649 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 Gm45321-201ENSMUST00000209286 2863 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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Sh3bp2Q06649 Gm27162-201ENSMUST00000185169 2478 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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Sh3bp2Q06649 Vmn2r17-201ENSMUST00000171841 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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Sh3bp2Q06649 Gm14008-201ENSMUST00000120483 274 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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Sh3bp2Q06649 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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Sh3bp2Q06649 Olfr875-202ENSMUST00000215128 2039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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Sh3bp2Q06649 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 Olfr365-203ENSMUST00000218602 5374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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Sh3bp2Q06649 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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Sh3bp2Q06649 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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Sh3bp2Q06649 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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Sh3bp2Q06649 Gm13096-201ENSMUST00000127752 251 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 Gm11816-201ENSMUST00000142744 353 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 Sox5os5-201ENSMUST00000152192 207 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 Gm22349-201ENSMUST00000157864 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 Gm23781-201ENSMUST00000157940 308 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 Gm7182-201ENSMUST00000193351 732 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 Gm44054-201ENSMUST00000203814 372 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms