Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm11982-201ENSMUST00000121480 314 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm22501-201ENSMUST00000158981 127 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm27445-201ENSMUST00000184484 72 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Rhoay-ps3-201ENSMUST00000187648 576 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm29023-201ENSMUST00000190543 325 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 1700025M24Rik-203ENSMUST00000191524 725 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm36934-201ENSMUST00000192007 306 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm37791-201ENSMUST00000195081 286 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm43500-201ENSMUST00000201067 312 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm7407-201ENSMUST00000208301 568 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm34838-201ENSMUST00000209231 958 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 AL645546.1-201ENSMUST00000225001 189 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Olfr561-201ENSMUST00000098217 1071 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 AC158921.1-201ENSMUST00000227861 3468 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm44689-201ENSMUST00000208786 1372 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Dock11-203ENSMUST00000115266 6047 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm37802-201ENSMUST00000194998 2643 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm44846-201ENSMUST00000207127 3243 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Vmn1r90-207ENSMUST00000227692 7101 ntAPPRIS P2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm14880-201ENSMUST00000117581 292 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm15613-201ENSMUST00000118396 326 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 4930421P07Rik-201ENSMUST00000147322 399 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm3848-202ENSMUST00000151564 301 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm6058-201ENSMUST00000154261 399 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm24976-201ENSMUST00000158972 135 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Ear-ps12-201ENSMUST00000161720 451 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm3646-201ENSMUST00000171319 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Mir3104-201ENSMUST00000174911 63 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm22120-201ENSMUST00000175590 70 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm3143-202ENSMUST00000198364 675 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 1700027F06Rik-201ENSMUST00000203901 243 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm44475-201ENSMUST00000204041 424 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm15927-204ENSMUST00000206075 372 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm35371-201ENSMUST00000216204 579 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 CAAA01216754.6-201ENSMUST00000217183 398 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 AC158631.1-201ENSMUST00000219202 138 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 AC156790.5-201ENSMUST00000227075 231 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Cdrt4-201ENSMUST00000035854 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm24626-201ENSMUST00000082621 161 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 9330159F19Rik-201ENSMUST00000092627 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm28634-201ENSMUST00000191087 2613 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Olfr796-202ENSMUST00000214584 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Olfr1093-203ENSMUST00000219561 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Olfr1253-202ENSMUST00000213484 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm24096-201ENSMUST00000103905 110 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Cyp4b1-ps2-201ENSMUST00000119563 333 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm15364-201ENSMUST00000119618 585 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm11430-201ENSMUST00000121317 217 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Vmn1r126-201ENSMUST00000168398 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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