Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm14404-201ENSMUST00000119117 1660 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm36944-201ENSMUST00000192257 2759 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm11490-201ENSMUST00000118128 272 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm25666-201ENSMUST00000157702 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm20698-201ENSMUST00000175657 233 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm37279-201ENSMUST00000194630 338 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Olfr528-ps1-201ENSMUST00000211655 728 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm31849-201ENSMUST00000220306 375 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 CT030184.1-201ENSMUST00000222393 416 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Olfr1051-202ENSMUST00000216432 2807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Olfr1051-203ENSMUST00000217245 2821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Olfr1051-204ENSMUST00000217294 2840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Olfr1186-202ENSMUST00000215912 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm14403-202ENSMUST00000108947 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Rpl31-ps14-201ENSMUST00000143596 378 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 n-R5s196-201ENSMUST00000083136 117 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Olfr1453-201ENSMUST00000087773 924 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm14429-201ENSMUST00000121881 2024 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms