Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm24445-201ENSMUST00000083981 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Olfr183-203ENSMUST00000213465 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Olfr183-205ENSMUST00000214916 2249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm12401-201ENSMUST00000118435 228 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm36954-201ENSMUST00000195362 363 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PtprmP28828 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PtprmP28828 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PtprmP28828 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Olfr857-201ENSMUST00000077023 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm21834-201ENSMUST00000178907 453 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PtprmP28828 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm13273-201ENSMUST00000119737 159 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Scgb2b9-ps-201ENSMUST00000189522 334 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm7407-201ENSMUST00000208301 568 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PtprmP28828 mt-Nd4l-201ENSMUST00000084013 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm44624-201ENSMUST00000208700 2278 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm15951-201ENSMUST00000118377 400 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Olfr1186-201ENSMUST00000121619 1090 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm28850-201ENSMUST00000189058 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Igkv13-80-1-201ENSMUST00000197926 255 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PtprmP28828 AC107808.2-201ENSMUST00000213542 1027 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PtprmP28828 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm23234-201ENSMUST00000157304 134 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Obox4-ps6-201ENSMUST00000176578 724 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PtprmP28828 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PtprmP28828 AC116557.1-201ENSMUST00000219494 1521 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm11433-201ENSMUST00000118318 228 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Gm2855-201ENSMUST00000166765 456 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Gm45063-201ENSMUST00000203726 472 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Gm44059-201ENSMUST00000204048 351 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PtprmP28828 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PtprmP28828 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Olfr1195-201ENSMUST00000099818 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Platr32-201ENSMUST00000148597 394 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Gm15230-201ENSMUST00000153701 510 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprmP28828 4930402F11Rik-203ENSMUST00000208289 606 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Olfr814-201ENSMUST00000081367 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Gm15095-201ENSMUST00000118996 1430 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Gm23708-201ENSMUST00000104367 123 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PtprmP28828 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Gm24061-201ENSMUST00000157489 120 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Gm3851-201ENSMUST00000168653 318 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Rian-214ENSMUST00000183026 596 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PtprmP28828 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.7 ms