Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm44472-201ENSMUST00000204922 943 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RxraP28700 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RxraP28700 AC153979.1-201ENSMUST00000219684 242 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm25480-201ENSMUST00000083217 133 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RxraP28700 Vmn2r38-201ENSMUST00000108554 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm42446-201ENSMUST00000199783 3284 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm21034-201ENSMUST00000207390 2608 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RxraP28700 Themis-201ENSMUST00000056097 5082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm43268-201ENSMUST00000201536 4055 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Zfp934-202ENSMUST00000101547 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 5330434G04Rik-203ENSMUST00000142109 3449 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm37494-202ENSMUST00000188038 16021 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Trav14d-2-201ENSMUST00000103597 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Trav14n-2-201ENSMUST00000103623 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm25438-201ENSMUST00000158281 110 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm24264-201ENSMUST00000179835 94 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Trav14-2-202ENSMUST00000184874 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm19641-201ENSMUST00000188432 417 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 AC153938.2-201ENSMUST00000218388 580 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 CT030161.1-201ENSMUST00000218411 124 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm4036-201ENSMUST00000220842 626 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm381-201ENSMUST00000117443 2037 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 Olfr164-202ENSMUST00000216157 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 Igkv9-129-201ENSMUST00000103308 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm25420-201ENSMUST00000104216 127 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm11221-201ENSMUST00000117230 597 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 Defa-ps9-201ENSMUST00000118264 276 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm12335-201ENSMUST00000119738 327 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm25105-201ENSMUST00000122477 130 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm14684-201ENSMUST00000145722 123 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm27520-201ENSMUST00000184872 81 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm28650-201ENSMUST00000188413 411 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 AC138401.1-201ENSMUST00000221533 116 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 Tas2r123-201ENSMUST00000071696 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 Olfr1095-201ENSMUST00000099874 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 Olfr116-202ENSMUST00000216128 4477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RxraP28700 Zfp711-201ENSMUST00000071814 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Zfp280c-204ENSMUST00000114940 3863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
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