Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm22034-201ENSMUST00000157283 134 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Mir6917-201ENSMUST00000184111 61 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm29327-201ENSMUST00000188229 388 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Olfr908-201ENSMUST00000215139 932 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm14440-202ENSMUST00000109051 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Prl7d1-203ENSMUST00000224026 3657 ntAPPRIS P2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Olfr732-202ENSMUST00000213701 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Ms4a14-201ENSMUST00000187467 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Mga-202ENSMUST00000079934 13304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Olfr469-202ENSMUST00000213252 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm25876-201ENSMUST00000104329 119 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm14785-201ENSMUST00000120185 539 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm25637-201ENSMUST00000157529 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm37568-201ENSMUST00000191755 364 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm23650-201ENSMUST00000083355 70 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Vmn2r23-201ENSMUST00000172391 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Zfp280c-203ENSMUST00000088898 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 A230004M16Rik-202ENSMUST00000139508 4468 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Olfr1309-203ENSMUST00000214935 5448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm14443-201ENSMUST00000109054 4516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Vmn2r-ps36-201ENSMUST00000172589 2562 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm26145-201ENSMUST00000104476 127 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Zfp950-205ENSMUST00000148569 192 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm24019-201ENSMUST00000178620 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm26243-201ENSMUST00000179260 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm28030-201ENSMUST00000184987 138 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm18921-201ENSMUST00000221798 366 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms