Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm42888-201ENSMUST00000202425 4361 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm16216-201ENSMUST00000118970 1111 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm14282-201ENSMUST00000119484 240 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Spink2-202ENSMUST00000120429 594 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm14810-201ENSMUST00000121628 486 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm11195-201ENSMUST00000135030 441 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm26275-201ENSMUST00000157101 268 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm5935-202ENSMUST00000178986 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm24264-201ENSMUST00000179835 94 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm26991-201ENSMUST00000180950 620 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Mir6914-201ENSMUST00000184999 69 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 2010110G14Rik-201ENSMUST00000196438 527 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Mir129b-201ENSMUST00000197461 65 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm44475-201ENSMUST00000204041 424 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm15927-204ENSMUST00000206075 372 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Olfr1490-201ENSMUST00000080162 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm24948-201ENSMUST00000082866 207 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm24268-201ENSMUST00000082990 110 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Mir133a-2-201ENSMUST00000083526 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Zfp260-202ENSMUST00000108200 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 2410141K09Rik-202ENSMUST00000172579 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Wac-217ENSMUST00000172018 1965 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Sult1b1-202ENSMUST00000117455 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm25765-201ENSMUST00000104100 132 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Mir1198-201ENSMUST00000116995 121 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm14684-201ENSMUST00000145722 123 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Vpreb1P13372 Gm26148-201ENSMUST00000157430 68 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.6 ms