Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-Eb1P04230 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-Eb1P04230 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-Eb1P04230 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-Eb1P04230 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-Eb1P04230 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-Eb1P04230 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-Eb1P04230 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-Eb1P04230 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-Eb1P04230 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-Eb1P04230 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-Eb1P04230 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-Eb1P04230 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-Eb1P04230 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-Eb1P04230 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-Eb1P04230 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-Eb1P04230 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-Eb1P04230 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-Eb1P04230 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-Eb1P04230 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-Eb1P04230 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-Eb1P04230 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-Eb1P04230 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-Eb1P04230 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-Eb1P04230 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-Eb1P04230 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-Eb1P04230 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-Eb1P04230 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-Eb1P04230 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-Eb1P04230 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-Eb1P04230 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-Eb1P04230 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Olfr837-202ENSMUST00000215699 3758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Olfr1487-204ENSMUST00000216688 2038 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Olfr799-202ENSMUST00000213820 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm12095-201ENSMUST00000121962 816 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm17154-201ENSMUST00000165748 431 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm26177-201ENSMUST00000178683 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Olfr908-201ENSMUST00000215139 932 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Olfr946-ps1-201ENSMUST00000217547 341 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 AC107453.2-201ENSMUST00000227714 655 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm14982-201ENSMUST00000121102 442 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm12412-201ENSMUST00000121867 328 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm26027-201ENSMUST00000122725 268 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm25283-201ENSMUST00000157272 77 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm5967-201ENSMUST00000172723 494 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
H2-Eb1P04230 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
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