Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm8041-201ENSMUST00000199755 616 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm24490-201ENSMUST00000083803 98 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Olfr381-202ENSMUST00000119863 1065 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm13853-201ENSMUST00000155496 557 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm28163-201ENSMUST00000187099 325 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm43232-201ENSMUST00000201346 364 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm44449-201ENSMUST00000203610 153 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm44135-201ENSMUST00000205221 368 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 AC164116.2-201ENSMUST00000225398 1038 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Mir190b-201ENSMUST00000104803 80 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm12478-201ENSMUST00000127709 353 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm21842-201ENSMUST00000177552 498 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm21626-201ENSMUST00000177791 498 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm21562-201ENSMUST00000177888 498 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm21539-201ENSMUST00000177925 498 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm17469-201ENSMUST00000177942 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm17693-201ENSMUST00000178004 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm17361-201ENSMUST00000178121 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm17522-201ENSMUST00000178144 498 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm21599-201ENSMUST00000178249 498 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm21616-201ENSMUST00000178416 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm21914-201ENSMUST00000178452 498 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm17584-201ENSMUST00000178471 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm21723-201ENSMUST00000178692 498 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm21916-201ENSMUST00000178771 498 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm21801-201ENSMUST00000178865 498 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm21633-201ENSMUST00000178941 498 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm17267-201ENSMUST00000178952 499 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
H2-M1F7CXU4 Gm21821-201ENSMUST00000179646 498 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.3 ms