Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm37899-201ENSMUST00000193116 8717 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1051-202ENSMUST00000216432 2807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1051-204ENSMUST00000217294 2840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm19427-201ENSMUST00000183619 208 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm13743-201ENSMUST00000121486 724 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm21742-201ENSMUST00000189352 548 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm22304-201ENSMUST00000082688 129 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Olfr172-202ENSMUST00000214139 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm22048-201ENSMUST00000104721 89 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Mir6904-201ENSMUST00000183443 67 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm45063-201ENSMUST00000203726 472 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 AC154270.1-201ENSMUST00000227226 426 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Rfpl4b-201ENSMUST00000179279 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm27580-201ENSMUST00000183666 149 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm6395-201ENSMUST00000167639 691 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm37778-201ENSMUST00000191732 190 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm15125-201ENSMUST00000116185 800 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm43500-201ENSMUST00000201067 312 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm13419-201ENSMUST00000121711 271 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 4933406D12Rik-201ENSMUST00000147212 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm23278-201ENSMUST00000157911 143 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Pdzd2E9Q1M1 Olfr787-201ENSMUST00000077836 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.1 ms