Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm43047-201ENSMUST00000200089 3460 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Olfr836-202ENSMUST00000212730 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm37387-201ENSMUST00000192201 1806 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Nlrp9a-202ENSMUST00000108387 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm12412-201ENSMUST00000121867 328 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm23234-201ENSMUST00000157304 134 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Ear-ps12-201ENSMUST00000161720 451 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm17119-201ENSMUST00000163943 280 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm26194-201ENSMUST00000175036 71 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Olfr1048-201ENSMUST00000099900 963 ntAPPRIS P2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Rictor-201ENSMUST00000061656 9312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Olfr397-204ENSMUST00000216291 4168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Hormad1-202ENSMUST00000090797 1511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm15190-201ENSMUST00000120855 276 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm17538-201ENSMUST00000168236 327 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm13698-201ENSMUST00000178325 732 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm13694-202ENSMUST00000178655 732 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm13696-201ENSMUST00000179311 732 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm13693-202ENSMUST00000179448 732 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm13695-202ENSMUST00000179504 732 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm13697-202ENSMUST00000179552 732 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm37692-201ENSMUST00000192633 232 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Olfr395-201ENSMUST00000072991 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Olfr924-202ENSMUST00000217350 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm18337-201ENSMUST00000219023 5762 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm25308-201ENSMUST00000104171 158 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm22722-201ENSMUST00000157467 132 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm22833-201ENSMUST00000158292 132 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm27028-201ENSMUST00000182303 399 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm27313-201ENSMUST00000183500 142 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm19498-201ENSMUST00000191128 331 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Igkv20-101-2-201ENSMUST00000200406 339 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm43899-201ENSMUST00000203675 246 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 AC107757.3-201ENSMUST00000226312 535 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm26129-201ENSMUST00000082719 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm14288-201ENSMUST00000109020 3438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Olfr1168-202ENSMUST00000215996 2322 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm45662-201ENSMUST00000210054 2098 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm12982-201ENSMUST00000117408 190 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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