Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm11389-201ENSMUST00000121407 430 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm12412-201ENSMUST00000121867 328 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm12095-201ENSMUST00000121962 816 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm26027-201ENSMUST00000122725 268 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm28802-201ENSMUST00000188624 944 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Fabp9-203ENSMUST00000193487 486 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm45430-201ENSMUST00000211276 260 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm46146-201ENSMUST00000217483 346 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 AC147633.1-201ENSMUST00000225134 259 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Vmn1r229-201ENSMUST00000076759 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm14899-201ENSMUST00000118673 548 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm14359-201ENSMUST00000118883 424 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Ear-ps3-201ENSMUST00000168308 445 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm28358-202ENSMUST00000189292 223 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm37987-201ENSMUST00000194999 825 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm15659-201ENSMUST00000118881 341 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm9043-201ENSMUST00000119677 314 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm13239-201ENSMUST00000119920 637 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm29009-201ENSMUST00000186340 496 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm44449-201ENSMUST00000203610 153 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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