Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm44283-201ENSMUST00000204461 3950 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm45235-201ENSMUST00000208016 4465 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Cybb-201ENSMUST00000015484 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r169-204ENSMUST00000227932 2745 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Igkv14-111-201ENSMUST00000103320 368 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 n-R5s52-201ENSMUST00000104614 113 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Hcfc1r1-ps2-201ENSMUST00000199379 339 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm3816-201ENSMUST00000209803 433 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm45826-201ENSMUST00000212226 265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 AC166902.1-201ENSMUST00000216653 517 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 AC161269.1-201ENSMUST00000228426 318 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 AC091683.1-201ENSMUST00000222307 2446 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Hm629797-201ENSMUST00000183645 2398 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Nufip2-201ENSMUST00000100802 5158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Oog2-201ENSMUST00000080405 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Cntn3-201ENSMUST00000032159 5183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Zfp984-202ENSMUST00000122309 2405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Ccser2-201ENSMUST00000067700 7334 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Elavl4-205ENSMUST00000106600 3799 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Abca16-201ENSMUST00000056042 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Ralgapa1-211ENSMUST00000220367 7473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Neat1-201ENSMUST00000173672 20771 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Rpl12-ps2-201ENSMUST00000121298 321 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm13174-201ENSMUST00000126141 220 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm6374-201ENSMUST00000159051 788 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm42570-201ENSMUST00000195937 292 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm32308-201ENSMUST00000203053 280 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm43955-201ENSMUST00000204332 142 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm18441-201ENSMUST00000223539 617 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 AC126253.2-201ENSMUST00000226518 205 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Stk-ps2-201ENSMUST00000051224 4667 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Defb39-201ENSMUST00000075504 252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm3095-201ENSMUST00000164696 1568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm21035-201ENSMUST00000207867 2608 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm43705-201ENSMUST00000195958 3717 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Cdh19-201ENSMUST00000094626 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm10552-201ENSMUST00000113396 372 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm15414-201ENSMUST00000155217 440 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm3636-202ENSMUST00000163850 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Tmem167-ps2-201ENSMUST00000190251 214 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm18384-201ENSMUST00000195974 808 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm44376-201ENSMUST00000197570 128 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm45513-201ENSMUST00000210228 376 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Cnot6l-202ENSMUST00000113005 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r51-201ENSMUST00000094863 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r167-202ENSMUST00000227713 2677 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Rps6ka3-204ENSMUST00000112493 3671 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Olfr1286-202ENSMUST00000184954 3398 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Mbnl1-219ENSMUST00000194201 4319 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 4930404H24Rik-201ENSMUST00000109783 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm15212-201ENSMUST00000122403 466 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm2182-201ENSMUST00000145243 663 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm26101-201ENSMUST00000157246 105 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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