Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm15926-201ENSMUST00000120492 550 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm14926-201ENSMUST00000120650 508 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm13511-201ENSMUST00000121167 363 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm6079-201ENSMUST00000121356 404 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm12924-201ENSMUST00000121747 318 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm28163-201ENSMUST00000187099 325 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm28920-201ENSMUST00000189957 699 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Igkv14-118-2-201ENSMUST00000198287 339 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Igkv14-126-1-201ENSMUST00000199899 346 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm15927-204ENSMUST00000206075 372 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Cftr-203ENSMUST00000115406 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Klhl13-205ENSMUST00000115319 3349 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm8744-201ENSMUST00000204475 3581 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Sorbs2-203ENSMUST00000124544 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Olfr992-203ENSMUST00000214895 2222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Olfr354-202ENSMUST00000217479 9539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Olfr733-203ENSMUST00000214756 3640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Btbd35f23-201ENSMUST00000189190 1943 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Olfr736-202ENSMUST00000213402 2402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm6760-201ENSMUST00000114682 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm5483-201ENSMUST00000114858 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm28822-201ENSMUST00000191140 778 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm37343-201ENSMUST00000192542 111 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 AC138401.2-201ENSMUST00000220461 365 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 AC125379.1-201ENSMUST00000221928 111 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Olfr1263-204ENSMUST00000217065 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm4788-203ENSMUST00000111989 3187 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 4932414N04Rik-201ENSMUST00000055930 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Olfr706-202ENSMUST00000213918 4828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Olfr1042-202ENSMUST00000215624 5096 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 AC153522.2-201ENSMUST00000218389 3853 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm22831-201ENSMUST00000102473 109 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm15147-201ENSMUST00000122263 483 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm28010-201ENSMUST00000179485 126 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm29327-201ENSMUST00000188229 388 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm34732-201ENSMUST00000195441 445 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm29704-201ENSMUST00000196011 253 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm45020-201ENSMUST00000205356 381 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Jrkl-201ENSMUST00000110582 3223 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Senp8-201ENSMUST00000051039 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Olfr1369-ps1-204ENSMUST00000215207 3794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r51-205ENSMUST00000227109 4214 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Olfr111-202ENSMUST00000214259 2620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm37674-201ENSMUST00000194177 1834 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 AC153563.1-202ENSMUST00000217695 1838 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Olfr113-201ENSMUST00000216181 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Pde1a-205ENSMUST00000102654 4122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Lrp1b-201ENSMUST00000052550 16294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Chrdl1-201ENSMUST00000063029 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm44164-201ENSMUST00000203605 2561 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Ugp2-202ENSMUST00000102875 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm11673-201ENSMUST00000117846 331 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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