Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm45173-201ENSMUST00000206819 305 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 AC156795.1-201ENSMUST00000214655 414 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 CT572983.1-201ENSMUST00000226895 514 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm37983-201ENSMUST00000193207 2006 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm14982-201ENSMUST00000121102 442 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Zfp950-205ENSMUST00000148569 192 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm43232-201ENSMUST00000201346 364 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm32222-201ENSMUST00000203296 298 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm46193-201ENSMUST00000219399 364 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 AC170810.3-201ENSMUST00000226177 374 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 AC166344.2-201ENSMUST00000226747 374 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Mir5129-201ENSMUST00000174938 78 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm29192-201ENSMUST00000190942 377 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Olfr967-201ENSMUST00000069561 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Olfr681-204ENSMUST00000215564 4487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Olfr747-204ENSMUST00000213238 1416 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Olfr164-202ENSMUST00000216157 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm22072-201ENSMUST00000116850 121 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Olfr1327-ps1-201ENSMUST00000117953 835 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm14359-201ENSMUST00000118883 424 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms