Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15094-201ENSMUST00000118394 1131 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12694-201ENSMUST00000149367 748 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28981-201ENSMUST00000190863 1288 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 CAAA01090811.1-201ENSMUST00000216828 277 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14404-201ENSMUST00000119117 1660 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14125-201ENSMUST00000113442 680 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13555-201ENSMUST00000121668 319 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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Ccdc39Q9D5Y1 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm8206-202ENSMUST00000168733 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn1r-ps74-201ENSMUST00000173518 570 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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Ccdc39Q9D5Y1 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1193-201ENSMUST00000081697 957 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1453-201ENSMUST00000087773 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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Ccdc39Q9D5Y1 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 AC154224.1-201ENSMUST00000224367 403 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 AC154506.3-201ENSMUST00000225417 213 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Tas2r118-201ENSMUST00000062463 900 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr805-201ENSMUST00000078876 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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