Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Olfr986-203ENSMUST00000216720 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Olfr263-202ENSMUST00000215804 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r80-209ENSMUST00000228578 11005 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Enam-202ENSMUST00000199104 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Stk31-202ENSMUST00000163954 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Olfr816-202ENSMUST00000213438 3306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 AC124572.2-201ENSMUST00000218041 5152 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Gm22269-201ENSMUST00000104002 130 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Gm14622-201ENSMUST00000117117 468 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Gm14753-201ENSMUST00000118503 246 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Gm8289-201ENSMUST00000144814 1182 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Gm24503-201ENSMUST00000158454 135 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r126-201ENSMUST00000168398 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 2310001H17Rik-201ENSMUST00000180379 521 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Gm27834-201ENSMUST00000183427 125 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Gm27445-201ENSMUST00000184484 72 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Gm3143-202ENSMUST00000198364 675 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Olfr832-201ENSMUST00000060601 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Olfr681-201ENSMUST00000098157 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Gm10666-201ENSMUST00000098722 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r114-201ENSMUST00000098737 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r93-201ENSMUST00000098747 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sgo1Q9CXH7 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Gm37777-201ENSMUST00000195546 3366 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Kctd12b-201ENSMUST00000039424 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Olfr1184-202ENSMUST00000216675 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Rab27b-203ENSMUST00000121693 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Pik3c2a-201ENSMUST00000170430 8044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Igkv1-110-201ENSMUST00000103321 401 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Gm14172-201ENSMUST00000118255 644 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Gm22613-201ENSMUST00000122679 292 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Gm6374-201ENSMUST00000159051 788 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Gm9376-201ENSMUST00000171107 729 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Gm3646-201ENSMUST00000171319 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Gm7449-201ENSMUST00000194393 663 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Gm43604-201ENSMUST00000199799 705 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Gm43155-201ENSMUST00000202661 494 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Gm45312-201ENSMUST00000210566 311 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Gm19219-201ENSMUST00000215863 724 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 AC134596.2-201ENSMUST00000222158 171 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Gm38207-201ENSMUST00000193009 3505 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Olfr796-202ENSMUST00000214584 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 A430106G13Rik-201ENSMUST00000182158 3388 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Gm24281-201ENSMUST00000104234 136 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Gm13307-201ENSMUST00000141375 493 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 Gm5963-201ENSMUST00000143451 236 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sgo1Q9CXH7 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms