Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm1553-201ENSMUST00000177934 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm42721-201ENSMUST00000197165 1523 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm12697-201ENSMUST00000118008 667 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Olfr837-202ENSMUST00000215699 3758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Ifi206-202ENSMUST00000169797 429 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm29513-201ENSMUST00000185741 202 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm31849-201ENSMUST00000220306 375 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 CT571268.1-201ENSMUST00000222320 407 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Zfp965-201ENSMUST00000109002 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm17119-201ENSMUST00000163943 280 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Mir5129-201ENSMUST00000174938 78 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps6-201ENSMUST00000201079 934 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Sult3a2-202ENSMUST00000223295 930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Klra6-201ENSMUST00000074056 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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