Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl36a-ps2-201ENSMUST00000197973 321 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45539-201ENSMUST00000210313 428 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 2210414F02Rik-201ENSMUST00000215316 396 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm30624-201ENSMUST00000220039 628 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 AC155929.1-201ENSMUST00000220217 1276 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm35558-203ENSMUST00000222264 204 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4987-201ENSMUST00000078326 408 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr136-202ENSMUST00000208525 2534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr913-201ENSMUST00000081095 2441 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1216-203ENSMUST00000217000 3667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1402-202ENSMUST00000199297 4051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45884-201ENSMUST00000209540 3416 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24125-201ENSMUST00000104105 137 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl10-ps4-201ENSMUST00000117120 286 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12149-201ENSMUST00000117511 654 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15783-201ENSMUST00000117521 633 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23887-201ENSMUST00000122683 172 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Pcgf1-204ENSMUST00000176089 492 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9712-201ENSMUST00000210842 311 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 AC153506.2-201ENSMUST00000218051 257 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 AC132384.5-201ENSMUST00000218562 226 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 AC101945.3-201ENSMUST00000226568 153 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 AC108416.2-201ENSMUST00000226792 367 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 AC121898.1-201ENSMUST00000227599 288 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr823-201ENSMUST00000081469 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Adam5-201ENSMUST00000050300 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr483-202ENSMUST00000215159 2691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43875-201ENSMUST00000203319 2475 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Igkv14-111-201ENSMUST00000103320 368 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14537-201ENSMUST00000117464 599 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14694-201ENSMUST00000121856 282 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9376-201ENSMUST00000171107 729 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22631-201ENSMUST00000179656 94 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42621-201ENSMUST00000198114 275 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8041-201ENSMUST00000199755 616 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms