Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm17538-201ENSMUST00000168236 327 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm44030-201ENSMUST00000204865 432 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Q3U6N9 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Q3U6N9 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Olfr164-201ENSMUST00000056727 1095 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Snora31-201ENSMUST00000083213 130 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Olfr918-202ENSMUST00000215461 3783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Olfr873-205ENSMUST00000215540 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Neb-203ENSMUST00000075301 21456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm38286-201ENSMUST00000195128 3105 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Olfr1454-203ENSMUST00000214695 4049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Sacs-203ENSMUST00000119943 14991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Olfr483-202ENSMUST00000215159 2691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm15127-203ENSMUST00000112753 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm24118-201ENSMUST00000103972 126 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm14119-201ENSMUST00000119511 235 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm14810-201ENSMUST00000121628 486 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm13748-201ENSMUST00000149820 378 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm26991-201ENSMUST00000180950 620 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm28954-201ENSMUST00000190031 437 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm13266-203ENSMUST00000193364 421 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm37743-201ENSMUST00000194645 376 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm31942-202ENSMUST00000195375 437 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm44877-201ENSMUST00000206485 274 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm38405-203ENSMUST00000208548 400 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 AC107864.1-201ENSMUST00000217937 496 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 CT030161.1-201ENSMUST00000218411 124 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 AC142499.1-201ENSMUST00000220036 374 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 AC167669.1-201ENSMUST00000224932 384 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 AC154262.1-201ENSMUST00000225976 286 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 AC108416.2-201ENSMUST00000226792 367 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Olfr824-201ENSMUST00000074161 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm42481-201ENSMUST00000196822 2178 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Olfr105-ps-202ENSMUST00000215518 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 AC153150.1-201ENSMUST00000226065 3782 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Vmn2r-ps69-201ENSMUST00000173382 2565 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Mga-202ENSMUST00000079934 13304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Erbin-205ENSMUST00000188997 5084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm17969-201ENSMUST00000185706 2557 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Olfr1434-201ENSMUST00000207186 2714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Olfr713-202ENSMUST00000213623 6329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Pkhd1l1-202ENSMUST00000166957 12747 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Pkhd1l1-201ENSMUST00000038336 12741 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Themis-201ENSMUST00000056097 5082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 AC154634.4-201ENSMUST00000226077 2665 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 2810403D21Rik-202ENSMUST00000124329 1660 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm16567-201ENSMUST00000160967 576 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Ranbp2-ps4-201ENSMUST00000183481 385 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Q3U6N9 Gm28781-201ENSMUST00000185760 696 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms