Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm5391-201ENSMUST00000121155 613 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm22601-201ENSMUST00000157595 250 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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Sh3bp2Q06649 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm8069-201ENSMUST00000197887 154 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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Sh3bp2Q06649 Olfr337-ps1-202ENSMUST00000213375 526 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm14399-201ENSMUST00000099029 192 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Cyp3a11-201ENSMUST00000035918 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 5930435M05Rik-201ENSMUST00000207572 3712 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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Sh3bp2Q06649 A930017M01Rik-205ENSMUST00000227721 4167 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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Sh3bp2Q06649 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Vmn1r169-204ENSMUST00000227932 2745 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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Sh3bp2Q06649 Adgrg2-201ENSMUST00000112398 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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Sh3bp2Q06649 Gm23319-201ENSMUST00000104467 131 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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Sh3bp2Q06649 Gm13174-201ENSMUST00000126141 220 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 2310016D23Rik-201ENSMUST00000130082 388 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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Sh3bp2Q06649 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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Sh3bp2Q06649 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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Sh3bp2Q06649 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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Sh3bp2Q06649 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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Sh3bp2Q06649 Gm24234-201ENSMUST00000104316 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 Gm15926-201ENSMUST00000120492 550 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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Sh3bp2Q06649 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 Gm17131-201ENSMUST00000164420 3846 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 Defa27-202ENSMUST00000168340 371 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 Gm3143-202ENSMUST00000198364 675 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp2Q06649 Gm3338-201ENSMUST00000220982 269 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 246.4 ms