Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm17538-201ENSMUST00000168236 327 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm23402-201ENSMUST00000178130 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm5168-201ENSMUST00000089165 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm42721-201ENSMUST00000197165 1523 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm13087-201ENSMUST00000118298 256 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Obox1-203ENSMUST00000172881 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm25120-201ENSMUST00000180148 79 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm19193-201ENSMUST00000190263 590 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm29192-201ENSMUST00000190942 377 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 4930404A12Rik-201ENSMUST00000199356 726 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Olfr187-201ENSMUST00000206428 978 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 AC069561.3-201ENSMUST00000217321 114 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Sult3a2-202ENSMUST00000223295 930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm10038-201ENSMUST00000077233 441 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms