Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm44808-201ENSMUST00000208887 264 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Olfr823-201ENSMUST00000081469 948 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm5152-202ENSMUST00000088625 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm23887-201ENSMUST00000122683 172 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm17186-201ENSMUST00000171742 456 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Gm21060J3KMU4 Gm24715-201ENSMUST00000102377 95 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Gm15780-201ENSMUST00000121283 935 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Gm8041-201ENSMUST00000199755 616 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Olfr1073-ps1-202ENSMUST00000215705 478 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Olfr204-201ENSMUST00000072517 918 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Gm26064-201ENSMUST00000083381 109 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Vmn2r-ps34-201ENSMUST00000177433 904 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Gm21060J3KMU4 AC153506.2-201ENSMUST00000218051 257 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.9 ms