Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-R5s196-201ENSMUST00000083136 117 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr835-202ENSMUST00000213018 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24925-201ENSMUST00000178157 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27520-201ENSMUST00000184872 81 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr505-ps1-201ENSMUST00000207626 976 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12313-201ENSMUST00000121347 421 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl31-ps14-201ENSMUST00000143596 378 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp3a44-201ENSMUST00000067479 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC134860.6-201ENSMUST00000226038 285 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1051-202ENSMUST00000216432 2807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1051-203ENSMUST00000217245 2821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1051-204ENSMUST00000217294 2840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14403-202ENSMUST00000108947 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9043-201ENSMUST00000119677 314 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44300-201ENSMUST00000196792 121 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9373-201ENSMUST00000208724 599 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45368-201ENSMUST00000209323 703 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms