Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm9119-201ENSMUST00000118866 495 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm24666-201ENSMUST00000158937 167 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Obox4-ps35-201ENSMUST00000173825 680 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Mir6914-201ENSMUST00000184999 69 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm29647-201ENSMUST00000188795 666 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm28504-201ENSMUST00000190977 666 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm35843-201ENSMUST00000193716 666 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Vmn1r30-203ENSMUST00000227466 1798 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Themis-201ENSMUST00000056097 5082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Pih1h3b-201ENSMUST00000044806 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Sacs-203ENSMUST00000119943 14991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm11816-201ENSMUST00000142744 353 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm22036-201ENSMUST00000157279 215 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm37431-201ENSMUST00000195102 111 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 AC138027.1-201ENSMUST00000218324 472 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 AC153564.2-201ENSMUST00000219464 273 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Olfr731-201ENSMUST00000059565 981 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Olfr1226-204ENSMUST00000215987 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Ms4a14-201ENSMUST00000187467 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm3259-201ENSMUST00000101015 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm15319-201ENSMUST00000084046 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Olfr1216-202ENSMUST00000216000 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm43924-201ENSMUST00000204851 1736 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Mier1-201ENSMUST00000030247 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Igkv4-57-201ENSMUST00000103357 352 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm14359-201ENSMUST00000118883 424 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Olfr439-ps1-201ENSMUST00000204679 307 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm39380-201ENSMUST00000214710 192 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Dst-211ENSMUST00000183034 23201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Grik3B1AS29 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Olfr196-202ENSMUST00000205471 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.4 ms