Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm23145-201ENSMUST00000178912 79 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 4930567K20Rik-203ENSMUST00000220108 646 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm18448-201ENSMUST00000186286 599 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm28981-201ENSMUST00000190863 1288 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm38333-201ENSMUST00000193608 604 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm45439-201ENSMUST00000211723 359 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm2768-201ENSMUST00000121062 250 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm44282-201ENSMUST00000203199 190 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 CT010455.1-201ENSMUST00000218579 413 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm816-201ENSMUST00000191156 2456 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm13627-201ENSMUST00000119700 706 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm46136-201ENSMUST00000214730 565 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 AC121844.1-201ENSMUST00000218706 137 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm10038-201ENSMUST00000077233 441 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Rtf1A2AQ19 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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