Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm13273-201ENSMUST00000119737 159 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm14591-201ENSMUST00000120407 518 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm12313-201ENSMUST00000121347 421 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm45742-201ENSMUST00000212400 433 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm24875-201ENSMUST00000158888 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm25412-201ENSMUST00000180258 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 AC101945.3-201ENSMUST00000226568 153 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Sult3a2-201ENSMUST00000165904 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Vmn2r-ps84-201ENSMUST00000173377 897 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Olfr1073-ps1-202ENSMUST00000215705 478 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm15087-201ENSMUST00000117465 1172 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm8206-202ENSMUST00000168733 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Olfr1489-201ENSMUST00000053113 1111 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Crisp3-201ENSMUST00000026499 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm23587-201ENSMUST00000157658 84 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm8161-201ENSMUST00000168739 481 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 9830004L10Rik-202ENSMUST00000188074 687 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PtprfA2A8L5 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.6 ms