Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm36954-201ENSMUST00000195362 363 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm6462-201ENSMUST00000081488 304 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm15679-201ENSMUST00000161244 1936 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm24863-201ENSMUST00000179499 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm11983-202ENSMUST00000184940 318 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm44403-201ENSMUST00000198554 129 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm7407-201ENSMUST00000208301 568 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm22646-201ENSMUST00000175130 115 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm21834-201ENSMUST00000178907 453 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Olfr1266-ps1-201ENSMUST00000214850 180 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 mt-Nd4l-201ENSMUST00000084013 297 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm22072-201ENSMUST00000116850 121 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm17186-201ENSMUST00000171742 456 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Rian-214ENSMUST00000183026 596 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm37290-201ENSMUST00000195775 339 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 AC107808.1-201ENSMUST00000213260 386 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Olfr1195-201ENSMUST00000099818 927 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm15143-201ENSMUST00000178180 714 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm26915-201ENSMUST00000183080 748 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Traj59-202ENSMUST00000197589 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 4930402F11Rik-203ENSMUST00000208289 606 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Olfr821-202ENSMUST00000205181 1993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Platr32-201ENSMUST00000148597 394 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm21170-201ENSMUST00000179330 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm19237-201ENSMUST00000205036 1132 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Tas2r114-201ENSMUST00000080619 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm24984-201ENSMUST00000104454 133 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm12230-201ENSMUST00000118301 454 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm25161-201ENSMUST00000158913 132 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm17153-201ENSMUST00000171314 490 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm28872-201ENSMUST00000191518 158 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Igkv13-80-1-201ENSMUST00000197926 255 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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