Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Slc7a12-202ENSMUST00000120484 1010 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm12065-201ENSMUST00000149592 656 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm17054-201ENSMUST00000169811 259 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 4930505G20Rik-201ENSMUST00000176582 561 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm38333-201ENSMUST00000193608 604 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 4921527H02Rik-202ENSMUST00000196005 947 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm45368-201ENSMUST00000209323 703 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm45439-201ENSMUST00000211723 359 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 AC122924.2-201ENSMUST00000220799 298 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 AC166358.6-201ENSMUST00000221834 1206 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 AC161758.1-201ENSMUST00000226123 310 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Olfr807-201ENSMUST00000059038 997 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.56□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Mir190b-201ENSMUST00000104803 80 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm14815-201ENSMUST00000120060 488 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm15309-201ENSMUST00000121644 240 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm45614-201ENSMUST00000209994 721 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm29817-201ENSMUST00000210098 172 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm25404-201ENSMUST00000082970 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm14981-201ENSMUST00000117325 943 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm15037-201ENSMUST00000120358 259 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm13443-201ENSMUST00000120770 555 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm2768-201ENSMUST00000121062 250 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm25666-201ENSMUST00000157702 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm8220-203ENSMUST00000177877 381 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 CAAA01090811.1-201ENSMUST00000216828 277 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm5168-201ENSMUST00000089165 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
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