Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Mir147-201ENSMUST00000102354 79 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm15613-201ENSMUST00000118396 326 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm16216-201ENSMUST00000118970 1111 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Spink2-202ENSMUST00000120429 594 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Mup-ps20-201ENSMUST00000121132 389 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm29380-201ENSMUST00000185898 416 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 1700121L16Rik-201ENSMUST00000189166 561 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm29334-201ENSMUST00000190334 357 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm28179-203ENSMUST00000191382 544 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm42927-201ENSMUST00000200624 3841 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm18423-201ENSMUST00000205144 1074 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 AC133517.1-202ENSMUST00000224409 233 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 AC166095.1-203ENSMUST00000224591 233 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r66-205ENSMUST00000228622 3304 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Jmjd1c-206ENSMUST00000173689 8609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Phf11c-201ENSMUST00000166912 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Ktn1-201ENSMUST00000022391 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm44525-201ENSMUST00000183129 2634 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm38073-201ENSMUST00000195141 3665 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Olfr826-203ENSMUST00000216661 2858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Slfn8-201ENSMUST00000038141 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 4931408C20Rik-201ENSMUST00000097801 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Hfm1-202ENSMUST00000117588 4870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm45389-201ENSMUST00000211163 3399 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Arrdc3-201ENSMUST00000099356 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Olfr1014-202ENSMUST00000213453 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Zfp131-202ENSMUST00000178271 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm11600-201ENSMUST00000119592 240 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Hba-ps4-201ENSMUST00000128900 447 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm15949-201ENSMUST00000129485 126 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm14161-201ENSMUST00000137020 339 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm24014-201ENSMUST00000157728 157 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm3851-201ENSMUST00000168653 318 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Olfr593-202ENSMUST00000210686 951 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 AC160124.1-201ENSMUST00000215539 519 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm34158-201ENSMUST00000216390 567 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 AC239878.1-201ENSMUST00000224212 506 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 BC002059-202ENSMUST00000190415 1964 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 AC159193.2-201ENSMUST00000220865 4251 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm8402-201ENSMUST00000118183 1770 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm8383-201ENSMUST00000121179 1770 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Ppef1-201ENSMUST00000071204 2483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Olfr1130-201ENSMUST00000213103 2643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 AC124572.2-201ENSMUST00000218041 5152 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 9430025C20Rik-201ENSMUST00000068663 2115 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm37777-201ENSMUST00000195546 3366 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm14875-201ENSMUST00000120881 319 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Ubl5-209ENSMUST00000161882 489 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 n-TSaga9-201ENSMUST00000197675 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Tgif1-ps-201ENSMUST00000201864 736 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm43440-201ENSMUST00000201957 729 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm44858-201ENSMUST00000207360 154 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm18602-201ENSMUST00000209794 851 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 CT009713.4-201ENSMUST00000224246 272 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 AC091783.5-201ENSMUST00000224928 671 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 AC134577.1-201ENSMUST00000227572 295 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm24147-201ENSMUST00000082763 144 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Ms4a2-204ENSMUST00000186978 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Tmem71-201ENSMUST00000048372 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm43834-201ENSMUST00000197097 4830 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm44435-201ENSMUST00000204379 4119 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RabggtaQ9JHK4 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
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