Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Gm14981-201ENSMUST00000117325 943 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Mir6383-201ENSMUST00000184545 116 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Gm29330-201ENSMUST00000190032 699 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Gm45438-201ENSMUST00000210242 564 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Gm36485-201ENSMUST00000214286 464 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 CT485608.1-201ENSMUST00000228759 389 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Gm24490-201ENSMUST00000083803 98 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Olfr136-203ENSMUST00000208539 1773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Postn-203ENSMUST00000107985 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
SgshQ9EQ08 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm14416-201ENSMUST00000118630 2308 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm25563-201ENSMUST00000104603 74 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 n-R5s52-201ENSMUST00000104614 113 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm25294-201ENSMUST00000122791 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm3848-202ENSMUST00000151564 301 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm24019-201ENSMUST00000178620 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm26243-201ENSMUST00000179260 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Olfr795-ps1-201ENSMUST00000205245 763 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 AC166358.6-201ENSMUST00000221834 1206 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 AC159621.1-201ENSMUST00000223249 163 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm23296-201ENSMUST00000082555 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm24859-201ENSMUST00000082729 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm597-201ENSMUST00000059937 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 A230004M16Rik-202ENSMUST00000139508 4468 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Xlr4e-ps-201ENSMUST00000122102 648 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Pnrc2-203ENSMUST00000180300 171 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm29023-201ENSMUST00000190543 325 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SgshQ9EQ08 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms