Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccdc47Q9D024 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccdc47Q9D024 Gm23402-201ENSMUST00000178130 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccdc47Q9D024 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccdc47Q9D024 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccdc47Q9D024 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccdc47Q9D024 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccdc47Q9D024 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccdc47Q9D024 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccdc47Q9D024 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccdc47Q9D024 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccdc47Q9D024 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccdc47Q9D024 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Olfr1051-204ENSMUST00000217294 2840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm14669-201ENSMUST00000118841 250 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm20776-201ENSMUST00000189940 700 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Cyp3a44-201ENSMUST00000067479 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Olfr835-202ENSMUST00000213018 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Zfp972-203ENSMUST00000108986 192 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Mup-ps1-201ENSMUST00000120720 544 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm22849-201ENSMUST00000157713 307 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 CT010455.1-201ENSMUST00000218579 413 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Olfr395-201ENSMUST00000072991 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm13194-201ENSMUST00000142299 311 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Arpp19-211ENSMUST00000170310 899 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 4921527H02Rik-202ENSMUST00000196005 947 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Sult2a2-201ENSMUST00000086148 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccdc47Q9D024 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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