Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm22792-201ENSMUST00000157225 133 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm21732-201ENSMUST00000179309 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Olfr187-201ENSMUST00000206428 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm18410-201ENSMUST00000207199 577 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm45438-201ENSMUST00000210242 564 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm11221-201ENSMUST00000117230 597 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm14951-201ENSMUST00000143622 570 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm8220-203ENSMUST00000177877 381 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm37104-201ENSMUST00000193278 196 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm46193-201ENSMUST00000219399 364 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s196-201ENSMUST00000083136 117 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm15961-201ENSMUST00000156090 266 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms