Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 Gm22849-201ENSMUST00000157713 307 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Def8Q99J78 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Def8Q99J78 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
Def8Q99J78 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
Def8Q99J78 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm14069-201ENSMUST00000120815 229 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm14979-201ENSMUST00000121561 1035 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm29330-201ENSMUST00000190032 699 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Def8Q99J78 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms