Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm12137-201ENSMUST00000119565 346 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm14586-201ENSMUST00000119571 408 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm13307-201ENSMUST00000141375 493 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm37343-201ENSMUST00000192542 111 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm19243-201ENSMUST00000198592 269 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Olfr580-ps1-201ENSMUST00000210528 943 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm4036-201ENSMUST00000220842 626 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 AC136976.1-201ENSMUST00000221440 381 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 1700112M02Rik-201ENSMUST00000221719 348 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 AC125379.1-201ENSMUST00000221928 111 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 AC126673.3-201ENSMUST00000223414 3829 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 AC129308.2-201ENSMUST00000224588 789 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 2610303G11Rik-201ENSMUST00000061643 517 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Mir28a-201ENSMUST00000083560 86 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm15679-201ENSMUST00000161244 1936 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Btbd35f23-201ENSMUST00000189190 1943 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Enam-202ENSMUST00000199104 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Trav12d-2-201ENSMUST00000103593 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Trav12n-2-201ENSMUST00000103619 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm11490-201ENSMUST00000118128 272 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm16216-201ENSMUST00000118970 1111 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm15643-201ENSMUST00000126556 383 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm22059-201ENSMUST00000157544 104 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm20693-201ENSMUST00000177431 211 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm28263-201ENSMUST00000185884 400 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Vmn2r-ps50-201ENSMUST00000209317 120 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Olfr1114-ps1-201ENSMUST00000213896 456 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 AC158523.1-201ENSMUST00000221398 328 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 AC117656.3-202ENSMUST00000225842 1055 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm6462-201ENSMUST00000081488 304 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm24626-201ENSMUST00000082621 161 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Zfp992-201ENSMUST00000105733 4550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Nufip2-201ENSMUST00000100802 5158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Zfp458-201ENSMUST00000045969 3488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Vmn1r30-205ENSMUST00000228635 1776 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm36298-201ENSMUST00000223394 1732 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 4930415L06Rik-201ENSMUST00000088146 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Olfr1196-203ENSMUST00000216977 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm43327-201ENSMUST00000199285 4055 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 4932414N04Rik-201ENSMUST00000055930 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Igkv1-131-201ENSMUST00000103306 362 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm14890-201ENSMUST00000117660 676 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm15537-201ENSMUST00000126677 485 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 1700123O12Rik-203ENSMUST00000145856 425 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm24059-201ENSMUST00000157493 312 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm23753-201ENSMUST00000157575 149 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Spin2g-201ENSMUST00000178425 687 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm5935-202ENSMUST00000178986 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Spink1-201ENSMUST00000025381 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxa13Q62424 Rpl31-ps13-201ENSMUST00000060994 378 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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