Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm5935-202ENSMUST00000178986 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm34599-201ENSMUST00000198924 288 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm43228-201ENSMUST00000200735 264 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm13082-201ENSMUST00000118877 561 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 n-R5s192-201ENSMUST00000122577 119 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm21732-201ENSMUST00000179309 1083 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm43043-201ENSMUST00000196579 412 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 AC158142.2-201ENSMUST00000227892 635 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 AC125523.1-201ENSMUST00000228018 934 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Olfr1327-ps1-201ENSMUST00000117953 835 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Odf1Q61999 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 291.6 ms