Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm24019-201ENSMUST00000178620 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm26243-201ENSMUST00000179260 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm32222-201ENSMUST00000203296 298 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm23296-201ENSMUST00000082555 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm24859-201ENSMUST00000082729 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm24120-201ENSMUST00000103978 129 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Cyp3a25-202ENSMUST00000138870 513 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1228-203ENSMUST00000216392 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 AC153506.2-201ENSMUST00000218051 257 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm29809-201ENSMUST00000218423 493 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm12814-201ENSMUST00000117091 846 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm15870-201ENSMUST00000132657 644 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm23467-201ENSMUST00000157127 159 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm23402-201ENSMUST00000178130 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm19224-201ENSMUST00000190477 793 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1489-201ENSMUST00000053113 1111 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Olfr209-201ENSMUST00000055868 918 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Olfr498-201ENSMUST00000217616 2260 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1165-ps-201ENSMUST00000117860 950 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm17186-201ENSMUST00000171742 456 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm44174-201ENSMUST00000205022 141 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 AC153568.1-201ENSMUST00000218165 341 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 AC183096.1-201ENSMUST00000226392 130 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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