Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Gm45854-201ENSMUST00000211857 3488 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm5117-201ENSMUST00000178878 2553 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Vmn1r1-203ENSMUST00000227629 3654 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Olfr753-ps1-204ENSMUST00000219487 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Vmn1r214-202ENSMUST00000227236 3892 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Ifi203-203ENSMUST00000123708 3482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 C230031I18Rik-201ENSMUST00000197856 3698 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 AI847159-204ENSMUST00000148997 753 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm5258-201ENSMUST00000165437 327 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gt(ROSA)26Sor-204ENSMUST00000167415 551 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Sprr2h-201ENSMUST00000059845 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Olfr681-201ENSMUST00000098157 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Olfr388-ps1-201ENSMUST00000118336 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm25089-201ENSMUST00000102015 79 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm11432-201ENSMUST00000117334 231 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm24916-201ENSMUST00000157287 79 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm22637-201ENSMUST00000158144 283 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Ubl5-209ENSMUST00000161882 489 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Mir5098-201ENSMUST00000175320 82 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Pcgf1-204ENSMUST00000176089 492 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm25840-201ENSMUST00000177821 79 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm24952-201ENSMUST00000177909 79 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm23682-201ENSMUST00000178146 79 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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Rnf40Q3U319 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm29314-201ENSMUST00000186800 615 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm28253-202ENSMUST00000187971 615 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm28896-201ENSMUST00000188609 696 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm29268-201ENSMUST00000188669 615 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm29169-201ENSMUST00000189835 615 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm37172-201ENSMUST00000191926 615 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf40Q3U319 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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